small RNA测序
产品名称： small RNA测序
英文名称： small RNA-Seq
产品编号：
产品价格： 5000
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更新时间： null
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广州市锐博生物科技有限公司
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技术简介
Small RNA是一类大小约17~40个碱基的单链小分子RNA，主要包括miRNA、snoRNA、piRNA等。小RNA在细胞内有重要的调控功能，具有作为疾病诊断标记物或药物靶标的潜力，正被广泛研究。新一代高通量测序可以在一次测序中获得样本细胞中小RNA的序列信息，能够快速鉴定出不同组织、不同发育阶段、不同疾病状态下已知和未知的小RNA表达水平及其表达差异，为研究小RNA对细胞进程的作用及其生物学影响提供了有力工具，尤其能通过测序鉴别新的小RNA。
技术特点
高分辨率：可以检测到单个碱基的差异
高精度：测序结果精确反映小RNA的表达水平
重复性好：深度测序保证了抽样的随机性，可靠性高，可不需要重复实验
能发现新分子：摆脱芯片依赖已知小RNA的局限，可以鉴定新的小RNA
灵活： Ion Torrent/MiSeq测序仪可在一天内完成上机测序;HiSeq 2500测序仪可以同时检测数百个样本
检测范围广：不仅可检测miRNA，还可检测snoRNA、piRNA等小RNA
服务流程
生物信息学分析内容
标准信息分析
1. 去除接头序列及低质量reads的处理
2. 公共及特有序列分析
3. 序列比对
4. 全基因组reads分布图谱
5. 已知miRNA比对
6. Repeat注释
7. ncRNA注释(rRNA / tRNA / snRNA / snoRNA / piRNA)
8. 外显子/内含子注释
9. RNA分类注释
10. 新miRNA预测
11. 样品间miRNA表达差异分析
12. miRNA表达聚类分析
定制化信息分析
1. miRNA靶基因预测(已知miRNA，模式生物)
2. miRNA靶基因预测(新miRNA)
3. 已知miRNA的碱基编辑
4. miRNA靶基因的GO功能富集分析
5. miRNA靶基因的KEGG通路富集分析
6. miRNA家族分析
7. miRNA保守性分析
8. miRNA的5p和3p表达差异分析
9. 构建miRNA调控网络