sRNA测序/mRNA测序/LnRNA测序

sRNA测序

Small RNA测序是基于Illumina HiSeq2500测序平台，研究特定组织在特定状态下的所有已知Small RNA，也可以发现新的或特有的Small RNA并预测其靶基因，为研究Small RNA的功能及基因调控机制提供了有力手段。Small RNA主要包括microRNA、siRNA(Small interfering RNA)、piRNA(piwi-interacting RNA)三类。

案例分析

利用Illumina第二代测序技术进了激素性股骨头坏死患者血浆miRNA的高通量测序研究。成功的构建激素性股骨头坏死患者血浆miRNA的cDNA文库。通过比较狼疮合并股骨头坏死患者与狼疮对照患者及健康志愿者的血浆miRNA测序结果，发现27个差异表达的血浆miRNA，其中15个miRNA表达上调，12个miRNA表达下调。研究为激素性股骨头坏死早期诊断的血清标记物研究奠定了基础。同时股骨股骨头坏死特异性miRNA的存在，提示miRNA可能参与了股骨头坏死发病过程的调控，其具体机制尚不明确，尚需进一步研究予以阐明。

选mRNA表达水平热图

mRNA测序

转录组测序是基于HiSeq平台，对待特定组织或者细胞在某个时期转录出来的所有mRNA进行测序，即可研究已知基因，亦能发掘新基因，全面快速地获得mRNA序列和风度信息。

案例分析

案 例 通过RNAseq技术全面解析乳腺癌组织中的可变剪切形式

乳腺癌组织由特定形式的转录本发挥特殊功能，本研究应用RNAseq技术获得了三种典型乳腺癌组织TNBC、non-TNBC和HER2阳性乳腺癌的转录本信息。该研究发现了新可变剪切形式和可变剪切后的新转录本，进一步研究发现，乳腺癌组织与正常乳腺组织在转录本表达水平和启动子转移水平存在显著差异，并RT-PCR验证CDK4，LARP1 , ADD3和PHLPP2等转录本形式。该研究第一次系统研究了不同亚型乳腺癌组织转录本利用可变剪切形式和转录本特异表达的情况。

LnRNA测序

长链非编码RNA测序介绍：

长链非编码RNA（long noncoding RNA, lncRNA）是一类长度超过200 nt的长链非编码RNA，通过与DNA、RNA或蛋白质结合，在表观遗传、转录及转录后等水平调控基因表达。
测序采用Illumina HiSeq平台进行测序，针对有参考基因组样本开展准确的lncRNA鉴定
和lncRNA靶基因预测，同时提供针对测序数据中mRNA的分析，结果更全面，广泛应用于医学、农学研究领域。

长链非编码RNA测序的特点：

LncRNA的研究作为RNA研究的新领域，在生产、生活、健康方面具有重要意义，可通过不同的分子生物学机制调控编码基因的表达，在生产上对物种的改良，在人类健康方面参与疾病相关的信号通路从而对疾病的发生发展及治疗有重要作用。

长链非编码RNA测序操作步骤：

1、研究对象的选取；

2、提取RNA，RNA量≥2.0ug;

3、链特异性文库的构建；

4、PE150测序（12-24Gb）;

5、信息分析，利用六步法对lncRNA进行准确筛选，高效预测靶基因，并完成对转录本中mRNA的分析，以及lncRNA和mRNA的比较分析、共表达网络构建。

客户提供目的样本：

如动物组织、细胞等以及相关的样本信息，需要干冰运输。

威斯腾生物服务流程

威斯腾生物服务项目

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