lncRNA 芯片
产品名称: lncRNA 芯片
英文名称: LncRNA chip
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北京康普森生物技术有限公司
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长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类转录本长度超过200nt、不编码蛋白的RNA,起初被认为是基因组
转录的“噪音”,不具有生物学功能。然而,近年来的研究表明lncRNA 能在表观遗传、转录及转录后水平上调控基因表达,
参与了X 染色体沉默、基因组印记以及染色质修饰、转录激活、转录干扰、核内运输等多种重要的调控过程,与人类疾病的发生、
发展和防治都有着密切联系, 但绝大部分的lncRNA 的功能仍然是不清楚的。目前主要通过lncRNA 芯片或新一代测序等方法
对lncRNA 进行功能研究。现阶段,基因芯片技术发展趋于成熟稳定,在此平台上,通过设计不同的lncRNA 探针,可以更加快速、
高通量地筛选出疾病或特定生物学过程中差异表达的lncRNA 和mRNA 信息,最终找到lncRNA 的靶基因位点深入分析调控机制。
芯片名称 物种 规格
Human lncRNA Microarray V4.0 人 4*180K
Agilent Sureprint G3 Human Gene Expression Microarray V2.0 人 8*60K
Affymetrix Genechip Human Transcriptome Array 2.0 人 1
Mouse lncRNA Microarray V2.0 小鼠 4*180K
Agilent Sureprint G3 Mouse Gene Expression Microarray 小鼠 8*60K
Rat lncRNA Microarray 大鼠 8*60K
Arabidopsis thaliana lncRNA Microarray v2.0 拟南芥 4*180K
样本要求
应提供的总RNA 浓度需大于200ng/μl, 体积大于30μl,总量大于2μg,吸光度OD260/280 比值在1.7-2.0 之间,琼脂糖电泳28S 和18S 单一明亮条带,并且28S 亮度是18S 的2 倍以上。客户也可以提供血液和组织样本由我方提RNA。具体的样本储存、运输要求请与工作人员联系。
服务内容
4.1 差异统计及Cluster 分析
4.2 lncRNA 与mRNA 关联分析
4.3 差异lncRNA 与mRNA 的共表达及聚类分析
4.4 lncRNA 功能预测
4.5 lncRNA 的cis 分析
4.6 lncRNA 的trans 分析
应用文献
◎ Z Du, et al. Integrative genomic analyses reveal clinically relevant long noncoding RNAs in human cancer. Nature Structural
& Molecular Biology. 2013. 全基因组研究揭示癌症相关的lncRNA
◎ Zhonghan Lia, et al. The long noncoding RNA THRIL regulates TNFα expression through its interaction with hnRNPL.
PNAS. 2014. lncRNA THRIL 通过与hnRNPL 的相互作用调节TNFα 的表达
◎ Song HJ, et al. Long non-coding RNA expression profile in human gastric cancer and its clinical significances. Journal oftranslational. 2014. lncRNA 在胃癌患者中的表达情况及临床意义
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