技术简介
m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰。研究表明，m1A是真核生物tRNA和rRNA丰度很高的一种转录后修饰，近期研究也表明m1A修饰可调控mRNA翻译。m1A修饰作为一类新型RNA甲基化，其功能和机制都亟待挖掘。

与m6A RNA检测方式一致，针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术，抗体富集的技术原理如下：将m1A RNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA片段进行共孵育，抓取有甲基化修饰的片段进行测序；同时需要平行测序一个对照（Input）样本，对照样本为未进行IP反应的RAN片段，对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。 

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云序优势

云序生物具有强大的生物信息学团队，能够满足客户的各类深入数据分析要求。

样本要求

数据分析

1、RNA甲基化富集峰分布图

2、RNA甲基化位点motif分析

3、RNA甲基化富集峰可视化图

4、差异甲基化区的GO和KEGG信号通路分析

案例解析

案例1：真核生物mRNA中m1A的动态修饰研究

芝加哥大学等处的科学家在国际杂志Nature上发表的一项研究论文，该研究通过m1A RNA甲基化测序技术在真核生物mRNA中对m1A甲基化作用进行全面的分析，揭示了m1A修饰可以明显增强基因向蛋白质的表达过程。并且m1A修饰具有进化保守性，在人类、啮齿类动物及酵母中普遍存在。

                                        图1. m1A RNA甲基化测序流程

原文：Base-Resolution Mapping Reveals Distinct m1A Methylome in Nuclear- and Mitochondrial-Encoded Transcripts

图2. 人转录组的m1A RNA修饰分布及对翻译效率的影响

图3. m1A甲基化位点motif分析

案例3：细胞核和线粒体编码的转录本的m1A甲基化修饰-Base-Resolution

期刊：Molecular Cell 影响因子：13.84

本研究通过单碱基分辨率方法的m1A RNA甲基化测序技术鉴定了细胞核和线粒体中m1A 甲基化修饰位点。结果发现大多数m1A甲基化修饰富集在mRNA的5’UTR，小部分符合“GUUCRA”基序的m1A 位点由一个已知的甲基化酶复合物TRMT6/61A 修饰。此外，线粒体编码的转录本中也有大量的m1A 甲基化修饰。该研究还表明，位于5’UTR 区，尤其是转录本第一和第二位上的m1A 可促进mRNA 翻译，而位于编码区的m1A 可抑制翻译作用。因此，m1A 测序不仅揭示了核编码和线粒体编码的转录本上不同类型的m1A 甲基化修饰，还为进一步m1A 甲基化功能验证提供了重要工具。

            图4.m1A-MAP揭示核编码和线粒体编码转录本上不同类型的m1A甲基化组