t-BA: 转录组数据基础分析 (transcriptome sequencing data Basic Analysis)
 

          本公司采用自主研发与成熟开源软件相结合的方式构建了专业高效的生物信息分析流程，对您获得的海量RNA-seq序列的质量和多种重要信息进行图形可视化。
 

技术路线：

1.      Pretreatment（有效序列Reads提取）

l  高通量测序质量评估，获得测序有效读长。

l  剔除每条序列中的index序列和adaptor序列。

l  获得有效序列总数。

2.      Mapping (全基因组定位)：让您“看见”自己样品中mRNA和ncRNA的分布状态。

l  Reads mapping: total mapped, unique mapped, multiple mapped.

l  Genomic distribution of the mapped reads。包括不同基因区域分布分析：

       （1）mRNA and ncRNA region

       （2）sense and antisense region

       （3）5’UTR, CDS, 3’UTR, intron, intergenic region

3.      mRNA coverage analysis（mRNA覆盖度和特征分析 ）：让您“看见”自己样品中mRNA的质量和特征。

l  盒须图分析mRNA不同区的reads coverage，以intron区作对照。

l  Read 在均一化的mRNA上的分布图。

4.      Expression analysis (mRNA 表达量分析)：让您“看见”自己样品中每个基因的表达量。

l  通过严格的标准化获得您样品中每个基因的可信表达丰度。

l  根据表达丰度对您样品中的基因分布趋势进行可视化。

我们的承诺：

l  提交您专业的项目结题报告。

l  普通项目完成时间一般为2-3个工作日。

您需要提供的样品：

如果您的RNA-seq过程不是在本公司完成，请您提供原始测序数据，样品介绍，以及您的项目需求。分析结果的可信度和深度依赖于您的测序质量和有效reads的数量。