单细胞蛋白质组学（Single-cell proteomics）分析是对组织解离得到的单个细胞进行蛋白质组学分析，包括单个细胞内蛋白质的组成、丰度和修饰状态等。相比常规的蛋白质组学研究，单细胞蛋白质组学的优势是能够得到单个细胞的信息，进行细胞类型特异性差异表达分析，为细胞异质性、生物系统复杂性和疾病机制提供革命性的见解，从而在更精细的水平上研究细胞行为和功能，高度适用于癌症研究、免疫学、发育生物学等。

单细胞蛋白组（Nat Methods 20, 324–326 (2023).）

细胞是目前我们所发现的生物体基本的结构和功能单位，也是一切生命活动的基础。在多细胞生物中，细胞间变异性至关重要，比如，肿瘤由多种细胞类型组成，包括癌细胞、成纤维细胞、免疫细胞和内皮细胞，每种细胞类型又由多个不同的细胞群组成。它们之间的密切相互作用通常会诱导肿瘤微环境中的细胞转化以支持肿瘤生长。由于细胞的高度异质性，传统水平蛋白质组学无法体现这些细微的差异，想探究特异性细胞亚群对癌症的发生发展、转移、免疫逃逸起到的作用，或者探究亚群的基因或蛋白寻找癌症质量创新靶点，都需要进行单细胞蛋白质组学分析。

肿瘤微环境（Cancer Discov (2021) 11 (4): 933-959.）

百泰派克生物科技单细胞蛋白质组学分析服务

百泰派克生物科技基于Thermozuìxiān进的Orbitrap Astral高分辨质谱仪以及Bruker的timsTOF HT设备，并配备全流程集成自动化的单细胞分选平台CellenONE，搭建了尖端的单细胞蛋白质组学分析平台，在高生物样本异质性的情况下实现精确的单细胞蛋白质组学稳定检测分析：

• 分选温和：采用压电声学分配技术，具有更低的剪切应力和损耗率，及更高的细胞存活率；
• 光学监控：采用高级视觉处理技术，通过软件集成的可视反馈自动判断后续分选操作；成功率高；
• 损失率低：单细胞分离率达98%，含多个细胞的液滴将回收用于再次分配；全流程的自动化；

分选得到的单细胞使用基本无损的蛋白前处理方法酶切，得到的肽段使用zuìxīn的，高灵敏度的Thermo Orbitrap Astral设备上机检测，保证数据质量，确保客户获得最全面的单细胞蛋白质组学图谱。

单细胞蛋白质组学分析流程

单细胞蛋白质组学分析优势

在过去的十年中，对大量单细胞进行的常规单细胞RNA测序极大地提高了我们对复杂生物系统潜在异质性的理解。技术进步也使蛋白质测量成为可能，有助于进一步阐明复杂组织中存在的细胞类型和状态。相比较单细胞转录组分析来说，做单细胞蛋白组学分析有更多的优势：

1. 与蛋白的相关性更高：bulk水平转录信息与蛋白之间的相关性约0.5，单细胞水平的相关性仅0.2左右（Mol Syst Biol (2022)18: e10798）

2. 体现蛋白翻译后修饰信息：PTM极大的丰富了蛋白种类，调节蛋白功能，这部分信息在mRNA中并没有体现

3. 机制不同：mRNA的表达调节和蛋白的活性调节是不同的机制，转录本的变异与蛋白结果，没有良好的相关性，两个数据可以起到互补作用

4. 蛋白的结果比较稳定，更接近真实细胞水平的表达谱：蛋白质的视角来解决细胞之间的异质性和个体之间的差异，从而发现细胞状态差异，细胞组成的改变，揭示生理病理现象，帮助寻找新的治疗靶点（Mol Cell. 2022;82(12):2335-2349）

蛋白与转录相关性（Cell Rep. 2023;42(11):113455.）

单细胞蛋白组学分析应用

医学领域：

1. 肿瘤异质性研究

2. 胚胎发育生物学研究

3. 免疫治疗临床实验

4. 靶点药开发

5. 免疫机制研究

6. 耐药与动力学研究

7. 干细胞分化潜能研究

8. 细胞图谱绘制

9. 精准病理检测等

农学领域：

1. 细胞特异的信号响应机制

2. 植物发育单细胞图谱

3. 胁迫抗逆

4. 品种单细胞修饰特征

5. 细胞动态和调控网络

6. 植物再生机制等

结果示例

中/英文项目报告

在技术报告中，百泰派克生物科技会为您提供详细的中英文双语版技术报告，报告包括：

1. 实验步骤（中英文）

2. 相关的质谱参数（中英文）

3. 质谱图片

4. 原始数据

5. 单细胞蛋白质分析详细信息

单细胞蛋白质组学分析一站式服务

您只需下单-寄送样品

百泰派克一站式服务完成：样品处理-上机分析-数据分析-项目报告

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其他相关服务

特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1.高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

六、基因敲除

百泰派克生物科技（BTP）采用优化的CRISPR/Cas9系统为您提供高通量基因敲除服务，包括病毒包装、质粒制备、Cas9浓度测试等，为您解决选择哪个细胞进行敲除、可不可以敲除、如何敲除以及敲除效率如何等关键问题。可进行单/多基因敲除、移码突变和大序列敲除。我们的人全基因组基因敲除阵列Array文库覆盖了完整的人类全基因组，全基因组阵列敲除库已在人原代细胞全部完成高内涵筛选的验证，超过80%以上的靶点达到70%以上的敲除效率。

※服务优势：

1.样本适用性强

适用于人、小鼠的细胞系，原代细胞，免疫细胞及iPS细胞等。

2.基因必要性及表达量分析

在进行基因敲除实验前，我们会基于生物信息学和蛋白质组学数据对不同细胞中基因必要性及表达量进行分析，确保实验的可行性，降低实验风险。

3.gRNA无需从头设计和验证

我们完成了人类全基因组gRNA的全部验证，与药物相关的靶点也完成了PCR测序验证，无需针对客户的靶点设计预实验进行gRNA验证，大大缩短了项目周期。

4.高通量高效率

我们采用优化的CRISPR/Cas9系统进行高通量基因敲除，多个sgRNA/靶基因设计保证高敲除效率，超过80%靶点敲除效率在70%以上，短期内（10天内）即可提供高敲除效率的KO pool，满足绝大多数的应用场景。

5.敲除效率双验证

基因敲除后，我们采用WB实验中抗体KO验证的shǒuxuǎn方法——Sanger测序和深度蛋白质组学技术对敲除效率进行双验证，数据真实性的双重保障。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!