单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism，SNP）分析是目前研究基因功能，寻找与疾病相关的基因及其突变位点，进行遗传连锁分析的一种重要的研究手段。联川生物为用户提供基于稳定的Illumina光纤微珠芯片平台的SNP基因分型服务 ，可对全基因组或特定SNP位点进行高质量的分析。

◆ 超高的芯片密度：可检测高达500万个SNP位点。

◆ 高质量的实验数据：无需PCR技术，不依赖限制性内切酶，在SNP位点的选择上可完全依据基因组情况来选择，芯片反应通过等位基因特异性延伸来完成，保证了高质量的实验数据。

◆ 完整的SNP和CNV分析方案：Illumina的GenomeStudio分析软件包提供了完整的拷贝数工具和Genome Viewer。

◆ 应用广泛：illumina SNP平台被广泛用于各种复杂疾病的研究，药物遗传学研究及禽畜的育种研究。

◆ 定制灵活：根据用户的需求，灵活的定制不同规格的SNP芯片。  

      除上表推荐的芯片外，我们还提供其他规格的人类SNP芯片，包括HumanOmni1S，HumanOmni2.5S，HumanOmni5Exome BeadChip等。  

我们可为用户提供基于illumina iSelect定制芯片平台（3K-1M个位点）或GoldenGate定制芯片平台（96-3072个位点）合成完全定制化的SNP芯片。科研人员可挑选感兴趣的SNP位点，合成探针组（OPA），进行基因分型研究。该方案适用于各种疾病的连锁分析或关联分析，药物基因组学研究，禽畜育种分型，其他物种（如植物，微生物等）遗传学研究等。

案例一：研发SNP芯片研究水稻生物学与分子育种¹

　   高密度单核苷酸多态性（SNP）芯片对遗传学家和分子育种人员非常重要。基于海量的基因组重测序数据，研究人员开发了一款基于Illumina Infinium平台的高密度水稻SNP芯片（RiceSNP50），包含有51,478个均匀分布的标记，它们筛选自超过10,000,000个SNP位点，这些SNP来自于801个水稻品种的重测序数据。系列测试表明此款芯片可成功用于水稻品种查证和基因杂交分析。  

图1   RiceSNP50芯片参数说明

A、SNP在水稻基因组上分布

B、RiceSNP50芯片上SNP间的距离

C、入选SNP的定位

D、入选SNP的MAFs

案例二：利用SNP芯片发现东亚人群高血压易感基因²

　   高血压是世界最常见的心血管疾病，也是最主要的流行病之一，常引起心、脑、肾等脏器的并发症，严重危害人类的健康。本研究采用GWAS研究方法对多达50,373名具有东亚血统的受试者进行筛查和确认，筛选出5个新的高血压相关位点，同时也确认了7个先前在欧洲人群中发现的高血压位点。此项研究的成果为高血压调节和寻找干预的潜在靶标提供了新的认识。

1. Chen H, Xie W, He H, et al. A high-density SNP genotyping array for rice biology and molecular breeding.  Mol Plant. 2014 , 7(3):541-53.  

2.Kato N, Takeuchi F, Tabara Y, et al. Meta-analysis of genome-wide association studies identifies common variants associated with blood pressure variation in east Asians. Nat Genet. 2011, 43(6): 531-538.

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