表达谱分析
产品名称: 表达谱分析
英文名称: Expression profiling
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更新时间: 2023-09-21T16:14:31
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晶能生物技术(上海)有限公司
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表达谱分析:通过芯片杂交信号的荧光强弱来得到mrna,mirna的表达量或者CpG位点的甲基化程度,利用统计学方法来筛选差异位点,最后借助功能分析来寻找可能的生物学解释。
A: 基本分析流程
B:部分结果展示
Box plot图:是利用数据中的五个统计量:最小值、第一四分位数(25%)、中位数(50%)、第三四分位数(75%)和最大值来描述数据的一种方法,它也可以粗略地看出数据是否具有有对称性,分布的分散程度等信息。
Pca图:通过降维度的方式来看样本间的相似程度,不同的颜色表示不同分组的样本。样本间距离越近表示样本基因的表达趋势约接近。
火山图:两条绿色直线对应fold change 2倍差异,绿色横线对应P=0.05,红色是差异基因区域
非监督聚类图:纵列表示样本横列表示基因,信号值的强度用色阶表示,进化树表示基因或者样本的相似程度。
自组织映射聚类SOM 分析:将变化趋势一致的基因聚类,横坐标是不同阶段,每条线表示一个基因的表达趋势。
Go关系图
Pathway图
网络关系图