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宏基因组测序

宏基因组测序

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产品名称: 宏基因组测序

英文名称: Meta seq

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技术简介

        宏基因组是指特定环境中全部生物(微生物)遗传物质的总和。宏基因组测序(Meta seq)指利用高通量测序技术对环境样品中全部微生物的DNA进行测序,分析微生物群体的基因组成及功能,解读微生物群体的多样性和丰度,探索微生物与环境及宿主之间的关系,发掘和研究新的具有特定功能的基因等。宏基因组测序研究避开了微生物分离培养的过程,扩展了微生物资源的利用空间,为微生物的研究提供了有效工具。


应用领域

人体微生物:解析人体微生物与人体间的相互关系,找到疾病关联的微生物,疾病诊断的生物靶标,微生态制剂的开发,包括口腔,肠道,胃,呼吸道,鼻腔,生殖道,血液,皮肤等等部位的微生物群落;
动物微生物:包括瘤胃,昆虫肠道等等部位的微生物;
植物微生物:植物的菌根等;
工业微生物:监测发酵微生物的群落动态结构变化,包括酿酒微生物,发酵微生物,沼气微生物等;
宿主环境:探索微生物与动物的互利共生关系,发现新基因,动物保健品开发;
生态环境:土壤,水体,活性污泥,空气中微生物生态系统,开发新的微生物活性物质;
极端环境:深海微生物资源的勘探与代谢活性产物研究,包括矿井、 古代动物的尸骨、极地、火山口等。


技术特点

高通量:一次测序得到百万级别以上条数的序列信息
高分辨率:可以精确检测至单碱基差异
重复性好:深度测序保证了检测的随机性,可不需技术重复
成本低耗时短:相比于Sanger测序,价格及成本要低很多


服务流程



生物信息学分析内容

标准信息分析
1. 物种组成和丰度统计
2. 样品复杂度分析
3. 样品间物种丰度差异分析
4. 基因组组装
5. 基因组组分分析(新基因、原噬菌体、可转座元件等)
6. 基因功能注释(GO-COG/KOG,KEGG)

定制化信息分析
1. 多样品显著相关因子分析
2. 与疾病相关的基因的深度分析
3. 构建菌群共生关系网络
4. 构建系统进化树