BSA混合池测序
产品名称: BSA混合池测序
英文名称: Pool-seq
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南京极光基因科技有限公司
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BSA的全称bulked segregant analysis,中文名叫集群分离分析法,是指利用目标性状存在极端表型差异的两个亲本构建家系,在子代分离群体中,选取两组表型差异极端的个体分别构建混合池,结合高通量测序技术对混合样本测序,检测与目标性状相关联的位点并对其进行注释,研究控制目标性状的基因及其分子机制。
实验流程
先提DNA再等量混合。
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样品要求
一般每个子代池混合的子代个体数为>=20个个体。测序深度的建议策略为:亲本10x左右,每个混合池为20x左右,
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交付结果
1, 原始序列数据
2 ,测序数据质量评估
3, 比对统计
4, SNP和InDel检测及注释
5, 子代SNP频率计算
6, 子代SNP频率差异分布 :计算△(SNP-index)
7, 基于SNP标记的目标性状区域定位
8, 其他标记的分析。
个性化的需求可根据具体物种及分析需求讨论方案及报价。