数字基因表达谱测序
产品名称： 数字基因表达谱测序
英文名称： gene expression seq(DGE)
产品编号：
产品价格： 4500
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广州市锐博生物科技有限公司
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技术简介
数字基因表达谱(DGE)测序指直接对某一物种或特定细胞在特定功能状态下产生的mRNA进行高通量测序，研究基因的表达差异情况，已被广泛应用于基础科学研究、疾病机理、生物标记和药物研发等领域。一次测序可产生5M以上的mRNA标签，可准确检测低丰度基因转录本，并同时检测反义链转录本。与芯片技术相比无交叉杂交和背景噪音信号干扰，被测得的次数即是对应基因的表达值，用数字信号代替了模拟信号，增加了数据的可信度。
锐博生物推出表达谱测序，该技术结合了转录组测序建库的实验方法与数字基因表达谱(Digital Gene Expression Tag Profiling, DGE)的信息分析手段，可广泛应用于生理调控、农业性状、生物标记、环境改造、疾病机制和药物筛选等领域。
技术特点
数字化信号：不需要基于预知序列信息的探针;测序直接获得序列，无背景噪音，无交叉杂交;可鉴别序列间单个碱基的差异
定量更准确：不仅可定性检测差异表达水平，还可定量检测基因的表达丰度;使用FPKM方法计算基因表达水平
良好的重复性：深度测序保证了抽样随机性，重复性非常好
任意物种的检测：适用于所有有参考基因组的真核物种
高通量：一次测序得到千万条级别以上的序列
服务流程
生物信息学分析内容
标准信息分析
1. 去除接头序列及低质量reads的处理
2. 测序质量评估
3. 参考基因组比对
4. 全基因组reads分布图谱
5. 基因表达分析
6. 差异基因KEGG生物通路富集分析
7. 差异基因GO功能富集分析
定制化信息分析
定制化信息分析
1. time series差异表达
2. 蛋白互作网络分析
3. 组间差异分析