动植物重测序

全基因组重测序是对已知基因组序列的物种进行不同个体的基因组测序，并在此基础上对个体或群体进行差异性分析。将不同梯度插入片段（Insert-Size）的测序文库结合短序列（Short-Reads）、双末端（Paired-End）进行测序，通过序列比对，可以找到大量的单核苷酸多态性位点（SNP），插入缺失位点（InDel，Insertion/Deletion）、结构变异位点（SV，Structure Variation）和拷贝数变异位点（CNV，copy number variation)。可以协助客户，通过生物信息手段，分析不同个体基因组间的结构差异，同时完成注释，实现遗传进化分析及重要性状候选基因预测。

技术路线

技术参数

样品要求

1. DNA样品：请提供浓度＞20 ng/μl，总量＞1 μg的DNA(单次建库50ng)，OD 260/280介于1.8-2.0之间，并确保DNA无降解，电泳检测无明显RNA条带，基因组条带清晰、完整，主带应在100 kb以上。若样品中有多糖、糖蛋白的残留，对打断DNA样品带来非常大的困难，且很难去除，因此特别要求所提供的样品不要有多糖或糖蛋白污染。

2. 植物样品：选取植物幼嫩组织，每个样品重量＞500mg，干冰或液氮保存寄送。
3. 动物样品：要求新鲜动物组织，避免脂肪组织，每个样品重量＞50mg。对于一般物种应挑选肝脏、肾脏、血液等组织取样，对于珍贵物种请提供耳样、毛发（带毛根）等脂肪含量较少的组织进行取样。为了减少个体差异对后续拼接产生的影响，尽量从同一个个体中取样。若物种体积较小，从一个个体中提取的DNA量不能满足测序实验所需，在保证量的前提下，应尽量减少采样个体的数量。提供组织样品应＞50 mg，尽量提供较多量，不同的物种DNA提取产量有差异。

4. 样品运输：送样管务必标清样品编号，管口使用Parafilm膜密封，样品请用干冰或者冰袋运输。干冰运输时间不要超过48小时；冰袋运输，时间最好不要超过24小时。样品保存期间切忌反复冻融。