RNA免疫共沉淀测序
产品名称： RNA免疫共沉淀测序
英文名称： RIP seq
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广州市锐博生物科技有限公司
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技术简介
RNA Immunoprecipitation (RIP) 是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术，是了解转录后调控网络动态过程的有力工具，能帮助我们发现miRNA的调节靶点。这种技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来，然后经过分离纯化就可以对结合在复合物上的RNA进行测序分析。
锐博生物推出RNA免疫共沉淀测序(RIP seq)，将RIP技术结合新一代测序技术，应用于癌症以及其它疾病整体水平的RNA变化检测。
RNA免疫共沉淀测序(RIP seq)实验原理见图1。
图1 RIP seq原理
技术特点
全转录组覆盖：与RIP芯片相比，可在全转录组范围对蛋白结合位点进行筛选与鉴定
高灵敏度：每个样本可获得数百万条的序列标签，可发现研究转录组上稀有的蛋白结合位点
高精确率：可获得高水平的信噪比数据，准确区分真实事件与噪音，精确定位蛋白结合位点
重复性好：深度测序保证了检测随机性，可不需技术重复
服务流程
生物信息学分析内容
标准信息分析
1. 去除接头序列及低质量reads的处理
2. 测序质量评估
3. 序列比对
4. 测序reads全转录组分布图
5. 结合峰鉴定
6. 结合峰基因元件分布
7. 差异结合峰检测
8. 差异结合峰相关基因GO功能富集分析
9. 差异结合峰相关基因KEGG生物通路富集分析
定制化信息分析
1. 结合峰的motif检测