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上海逆耳生物科技有限公司
illumina 270K 生物芯片服务

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产品名称: illumina 270K 生物芯片服务

英文名称: illumina 270K methylation microarray

产品编号: 270K甲基化芯片

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更新时间: 2024-06-26T16:48:35

使用范围: null

上海逆耳生物科技有限公司
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InfiniumTM Methylation Screening Array-48 芯片,简称“270K甲基化芯片”。

 

用于群体表观基因组学研究的高通量甲基化分析

• 重点覆盖与常见人类特征、疾病表型、环境暴露、衰老等内容相关的 27 万个独特甲基化位点

• 一张芯片容纳 48 个样本的芯片,在 iScanTM 芯片扫描仪上进行扫描,每年可处理多达 60 万个样本

• 可靠的甲基化数据,样本间可重现性超过 98%

 

用于甲基化研究的高通量芯片

270K 甲基化芯片旨在采用专家精选内容对群体队列开展大规模表观遗传分析,涵盖已知和预测的表观遗传关联。该芯片基于 48 个样本的 EX Methylation 平台,旨在打造更具可扩展性且价格实惠的 Infinium 甲基化芯片,提供可靠、准确的甲基化数据及简化分析。

 

专家选择的群体健康 EWAS 的位点

270K 甲基化芯片具有 27 万个甲基化位点,专注于与一系列常见细胞和生物体特征相关的 CpG 区域,例如细胞特性、非恶性疾病表型和环境暴露。之所以选择 Beadchip 内容,是因为其结合了 Infinium 甲基化研究、功能基因组学测序研究和最新基因组学数据库,具有强大的已明确的性状关联。

 

表 1: 270K甲基化芯片规格

 

Infinium Methylation Screening Array

用于群体健康研究的靶向甲基化筛查

推荐应用

• 常见疾病研究(非癌症)

• 环境流行病学

• 群体基因组学

• 消费者基因组学

关注内容

• 已知的常见疾病特征关联

• 已知的环境暴露关联

• 细胞类型特异性甲基化

• 中间甲基化

• 检测高 MAF SNP 的多组学能力

独特甲基化位点总数

269,094

每个 BeadChip 芯片的样本数

48

DNA 起始量要求

50 ng

检测技术

Infinium EX Methylation

测序仪兼容性

iScan芯片扫描仪

iScan 系统最大样本通量

16,128 个样本 / 周

液体处理自动化

Infinium 自动移液系统,带 ILASS(必备)

 

 

图 1: Infinium Methylation Screening Array⸺该 BeadChip 能够对 27 万个专家选择的甲基化位点进行高效、准确的分析,每个 Beadchip 可处理 48 个样本。

 

270K 甲基化芯片的专注设计和更高的样本通量让研究人员能够将 DNA 甲基化筛查应用于大型群体健康项目,发现有意义的疾病靶点。

 

270K 甲基化芯片的已知关联

270K 甲基化芯片上约 50% 的位点来自于对已发布数据、科学文献和 Infinium 甲基化芯片的分析,这些位点旨在发现 CpG 甲基化与不同性状或疾病的关联。根据样本数量、统计可靠性和科学影响,审核和筛选了 1000 多项 EWAS 研究。优先使用最具统计显著性和效应的探针并平衡选择,对各种性状和疾病做出最充分的描述。所选内容与多种生物类别相关,包括心血管、代谢、神经退行性 / 精神疾病、自身免疫、呼吸系统、生殖、肾脏、衰老、遗传、环境暴露以及感染相关特征和疾病。还包括先前和现有 Infinium BeadChip 平台的表观遗传时钟和细胞反卷积 panel,为 EWAS 研究中的细胞类型估计和表型预测的既定预测因子提供向下兼容。

 

 

表 2: 先前在 Infinium Methylation Screening Array 上已验证的性状相关内容

性状类别

靶向性状关联的探针数量

发育 / 衰老

102,533

环境暴露

44,043

炎症 / 自身免疫性疾病

41,894

祖源

31,843

性别

23,806

传染性疾病

14,844

代谢疾病

13,739

罕见遗传病

13,429

神经 / 神经发育疾病

8874

身体特征(身体形态)

8109

精神障碍

7280

心血管疾病

7007

生殖生物学 / 健康

6999

神经退行性疾病

4733

肺 / 呼吸道疾病

1748

肾脏疾病

982