长链非编码RNA（lncRNA）

IncRNA 研究策略：

1. 差异表达筛选
通过lncRNA芯片或RNA-seq测序等方法对疾病模型和对照样本组织进行lncRNA表达谱分析。

2. 生物信息分析
通过生物信息学的方法筛选出具有表达差异的lncRNA，构建共表达网络，预测lncRNA的靶基因。

3. 细胞分子水平研究
（1）功能获得性研究：构建lncRNA过表达载体
（2）功能缺失性研究：可通过siRNA、shRNA、反义核酸等方法沉默lncRNA。

通过过表达或者干扰LncRNA来检测其对疾病相关基因表达的影响，以及对细胞表型如增值、凋亡、侵袭、转移等的影响
    （3）可通过RNA pull down、RNA-RIP、ChIRP-seq等方法检测与lncRNA结合的DNA、RNA、蛋白质。

4. 动物实验
（1）构建移植瘤或原位瘤模型，转移模型
（2）导入siRNA或者lncRNA表达质粒
（3）检测肿瘤生长曲线
（4）通过免疫组化、RT-PCR、Western Blot等方法检测相关指标变化。

附 IncRNA简介：

长链非编码RNA（lncRNA）是一类转录本长度超过200nt的RNA分子，它们并不编码蛋白，而是以RNA的形式在多种层面上（表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等）调控基因的表达水平。

lncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”，是RNA聚合酶II转录的副产物，不具有生物学功能。然而，近年来的研究表明，lncRNA参与了X染色体沉默，基因组印记以及染色质修饰，转录激活，转录干扰，核内运输等多种重要的调控过程，lncRNA的这些调控作用也开始引起人们广泛的关注。哺乳动物 基因组序列中4%~9%的序列产生的转录本是lncRNA（相应的蛋白编码RNA的比例是1%），虽然近年来关于lncRNA的研究进展迅猛，但是绝大部分的lncRNA的功能仍然是不清楚的，随着研究的推进，各类 lncRNA 的大量发现，lncRNA 的研究将是 RNA 基因组研究非常吸引人的一个方向，使人们逐渐认识到基因组存在人类知之甚少的“暗物质”。

lncRNA特征

● lncRNA通常较长，具有mRNA样结构，经过剪接，具有poly(A)尾巴与启动子结构，分化过程中有动态的表达与不同的剪接方式, 与编码基因相比，lncRNA表达量更低。

● 组织特异性：不同组织之间的lncRNA表达量不同。

● 时空特异性：同一组织或器官的不同生长阶段，其中的lncRNA表达量也会变化。

● lncRNA启动子同样可以结合转录因子，如Oct3/4，Nanog，CREB，Sp1，c-myc，Sox2与p53，局部染色质组蛋白同样具有特征性的修饰方式与结构特征。

● 大多数的lncRNA在组织分化发育过程中，都具有明显的时空表达特异性，如有人针对小鼠的1300个lncRNA进行研究，发现在脑组织中的不同部位，lncRNA具有不同的表达模式。

● 在肿瘤与其他疾病中有特征性的表达方式。