RainDrop™油滴式数字PCR系统
产品名称: RainDrop™油滴式数字PCR系统
英文名称: RainDrop™Digital PCR System
产品编号: RainDrop™数字PCR系统
产品价格: 0
产品产地: 美国
品牌商标: RainDance
更新时间: null
使用范围: null
上海基龙生物科技有限公司
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如今多种高发病已知原因均与遗传性变异有关,遗传性变异导致个体化差异,直接或间接引起多种疾病发生及发展,如癌症进级、代谢类疾病、妊娠类疾病等。随着人类测序工作完成,多种与疾病相关遗传性信息提供研究者参考,广泛应用于疾病早期发现、早期诊断、疾病进程监视和个体化用药等多领域开发研究,如SNP(Single Nucleotide Polymorphism,单核苷酸多态性)、CNV(Copy Number Variations,拷贝数变异)、 DSG (disease susceptibility gene,疾病易感基因) 等。针对疾病诊断和疾病监视,困难点在于有变异影响因素的细胞仅占检体材料的极少部分,如体细胞突变检测、基因拷贝数变异检测、等位基因表达变异、染色体移位和融合基因变异等方面。这是现有实时定量PCR技术和AMOS-PCR技术所无法实现的,1999年VOGELSTEIN和KINZLER提出了Digital PCR(数字式PCR)理论,至今新一代油滴式数字PCR系统可以实现超高的灵敏度和精确地定量拷贝数,可检测灵敏度低至1/1,000,000,比现有的PCR技术提高了1000倍的检测灵敏度。
美国RainDance Technologies公司由科学奇才Jonathan Rothberg创办,他同时也是454生命科学(现已被罗氏收购)和Ion Torrent(现已被Life Tech收购)的创始人。该公司核心的RainStorm™技术可在短时间内生成千万个皮升级的微液滴,每个液滴包裹单个靶向分子或反应物质,实现数字化分析。
美国RainDance Technologies公司在美国癌症研究学会(AACR)的年会上推出一款高灵敏度RainDrop™数字PCR(ddPCR)系统。RainDrop系统基于专利的RainStorm™ 微液滴(pico-droplet)技术,实现皮升级油滴计数功能,每个通道能将反应样本包埋在稳定的1000万个小油滴的反应体系并独立进行PCR反应,实现目标分子的绝对定量,如下图。在检测灵敏度、定量准确性、多重反应技术等方面都远远优于现有技术,是目前唯一可以达到单分子扩增的技术平台。
与传统的qPCR或者低阶的dPCR相比,该系统可以解决qPCR无法检测到100个拷贝以下的目标分子问题,准确定量到25万个野生型中的一个突变型,提高大约1000倍的敏感度。同时,该系统可以实现多重检测,无需分管操作,避免分管检测造成的假阴性,同时降低耗材成本。广泛应用于癌症中稀有突变检测(rare mutation detection)、拷贝数突变检测(CNV)、低频率的病毒检测以及产前检测等。
其中在liquid biopsy方面,系统可以直接定量到血液中的几十万分之一突变频率的循环DNA。法国Paris-Desacartes Univesity的Dr. Valerie Taly用系统检测结直肠癌中7个KRAS突变位点。从病人血浆中得到的循环DNA,通过调节探针FAM和VIC浓度实现多重检测,其7个KRAS突变位点CV都高于95%。
在CNV(多拷贝数突变)的检测方面,该系统准确检测出SMA(骨髓性肌肉萎缩症)的SMN2的1到5个拷贝的突变、 SMN1拷贝数缺失以及SMN1 c.815A单位点突变。无需分管也可达到不同突变类型的多重检测。
高灵敏度、开放平台、闭关设计、简单操作等优势使得RainDrop平台广泛受到国外用户推崇。世界知名癌症研究中心Fred Hutchinson Cancer Center的Dr.Jason Bielas指出,相较于同类产品,RainDrop这样的试剂开放平台,可以让他们用已有的试剂去开展更为广泛的应用。美国加州DxTerity诊断公司Bob Terbrueggen(CEO)也提到,他们完全使用自己已有的试剂,利用该系统去进行HER-2的检测,在不改变任何反应条件的情况下仍然可以准确检测出32倍的变化。他们完全相信RainDrop系统可以让他们开发出更为简单、更高多重性、绝对定量的基因分析方法。