10X | 单细胞 RNA 测序
产品名称: 10X | 单细胞 RNA 测序
英文名称: 10X | 单细胞 RNA 测序
产品编号: 72
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产品产地: null
品牌商标: null
更新时间: 2024-07-18T09:41:20
使用范围: null
- 联系人 : 付先生
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- 所在区域 : 上海
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10X Genomics
10X Genomics 公司的 Chromium 系统利用 8 通道的微流体“双十字”交叉系统,将含 barcode 的凝胶珠(Gel Beads)、细胞和酶的混合物、油三者混合,形成 GEMs(油包水的微体系)。GEMs 形成后,细胞裂解,凝胶珠自动溶解释放大量 barcode 序列,随后 mRNA 逆转录产生带有 10X barcode 和 UMI 信息的 cDNA,构建标准测序文库,其中 10X barcode 用于区分细胞,UMI 用于区分 mRNA 分子。
图 10X genomics 技术原理
伯豪生物提供:单细胞转录组测序、生信分析整体科研技术服务,伯豪生物单细胞转录组测序科研服务商,24 小时咨询服务热线:021-58955370
1、通量高: 一张芯片具有 8 个独立的通道,可供 8 个样本同时上机,每个通道可捕获 10000 个细胞。
2、捕获率高: 单细胞捕获效率高达 65%,多细胞比例 <0.9%(1,000 个细胞中)。
3、延展性强: 除了获得单细胞 mRNA 的信息,还提供了单细胞 TCR/BCR、单细胞表面蛋白、单细胞 ATAC 等多种解决方案。
文库结构
图 10X Genomics 3’gene expression 文库示意图
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建议测序深度及参数
指标 |
参数 |
测序深度 |
50,000~100,000 reads/cell |
测序类型 |
PE150 |
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1、类型:新鲜组织,原代细胞,细胞系等。
2、来源:血液提取、磁珠富集、流式富集、组织解离等。
3、样本量及其它质控要求:
样本类型 | 样本质控要求 |
细胞悬液 | >105 目标细胞个数(底限 10,000 个细胞); |
活率 >80%; | |
浓度 500-1,000 个细胞 /ul; | |
细胞间无粘连(成团率 <5%); | |
无大于 40μm 的细胞碎片或其他颗粒物; | |
不存在逆转录抑制剂和非细胞的核酸分子。 | |
血液 | EDTA 抗凝的全血(不可肝素抗凝),>5ml。 |
组织 | 0.3cm×0.3cm(不超过 0.5cm×0.5cm)的新鲜组织,4~5 块。 |
4、保存运输:
(1)细胞悬液:建议现场制备,如要运输,建议使用伯豪生物自主研发的单细胞保护液,4°C 运输,48 小时内送达伯豪生物实验室。
(2)血液:EDTA 抗凝的全血,4°C 运输,2 小时内送达伯豪生物实验室;或提取 PBMC 后冻存,干冰运输。
(3)组织:建议使用伯豪生物自主研发的单细胞组织保护液,4°C 运输,48 小时内送达伯豪生物实验室。
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