技术简介

转运RNA(tRNA)是一类具有携带并转运氨基酸功能的非编码小RNA。tRNA除了参与蛋白合成外，还参与调控多种生理病理过程。最新研究表明：tRNA能通过多种机制调控基因的表达，与肿瘤、代谢疾病、神经退行性疾病甚至病毒感染等重大疾病的发生发展息息相关。

成熟tRNA丰富的转录后修饰和二级结构都限制了传统RNA-seq的加接头和cDNA合成效率，云序生物的tRNA测序可以有效地去除tRNA的内部修饰和末端修饰，使得tRNA测序获得更高的检测效率和更高的精准度，防止信息的丢失，为客户提供完整的测序报告。

tRNA-seq流程图

云序优势
高检测效率和高精准度：
有效去除tRNA甲基化修饰和末端修饰，使tRNA-seq具有高检测效率和高精准度。
系统性服务：
系统性提供tRNA测序、tiRNA和tRF测序、tRNA m5C甲基化测序等tRNA相关产品服务。
数据全面：
最权威的tRNA数据库，全面的tRNA表达谱分析。
专业的生物信息学分析：
云序生物具有强大的生物信息学团队，能够满足客户的各类深入数据分析要求。
样本要求
样品类型：
组织、细胞、体液或RNA样品。其它类型样品请详询。
样品量：

a) 细胞：2×10⁷

b) 组织：100 mg

c) 体液：全血、血清、血浆2-3 ml

脑脊液：5 ml

尿液：50 ml

d) 总RNA：2 μg (OD260/280≥1.8;OD260/230≥1.5; 无明显降解，电泳检测样品特征性条带完整清晰，无明显弥散或拖尾) 

样品运输及保存：

样品运输：样品置于1.5mL管中，封口膜封好，干冰运输 

样品保存：细胞样品或新鲜组织块，可用TRIZOL或RNA保护剂处理，液氮冻存后，-80℃保存，RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存，样品保存期间避免反复冻融。 

数据分析
1、tRNA长度统计图

2、tRNA散点图

3、差异表达的tRNA聚类分析

4、编码tRNA基因启动子motif分析

5、反密码子分析

案例解析
案例1：tRNA促进乳腺癌转移
原文：Modulated Expression of Specific tRNAs Drives Gene Expression and Cancer Progression

期刊：Cell 影响因子：31.39
本文通过tRNA测序和严谨的生物信息学分析，发现高转移性乳腺癌细胞亚株MDA-LM2与CN-LM1a中某些特异性tRNA水平上调会使细胞获得转移能力。通过相应实验证实，tRNA GluUUC与tRNA ArgCCG是乳腺癌转移的助推因子。tRNA GluUUC与tRNA ArgCCG的上调会增加转录本稳定性及转录本与核糖体的结合力，这一调控作用具有密码子特异性。特别是tRNA GluUUC可通过直接增强下游靶基因EXOSC2和GRIPAP1表达进而形成一条受tRNA驱动的“可诱导”通路，从而促进乳腺癌的转移。

图1. 不同细胞中差异表达的tRNA，特异性tRNA与转移乳腺癌细胞的相关性