DNA CpG甲基化检测—BSP法
产品名称: DNA CpG甲基化检测—BSP法
英文名称: DNA CpG BSP
产品编号: BSP
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贺融义生(北京)科技有限公司
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BSP法简介:
DNA甲基化是一种表观遗传修饰,它是由DNA甲基转移酶(DNA methyl-transferase, Dnmt)催化S-腺苷甲硫氨酸作为甲基供体,将胞嘧啶转变为5-甲基胞嘧啶(mC)的一种反应,在真核生物DNA中,5-甲基胞嘧啶是唯一存在的化学性修饰碱基。CG二核苷酸是最主要的甲基化位点,它在基因组中呈不均匀分布,存在高甲基化、低甲基化和非甲基化的区域,在哺乳动物中mC约占C总量的2-7%。一般说来,DNA的甲基化会抑制基因的表达。DNA的甲基化对维持染色体的结构、X染色体的失活、基因印记和肿瘤的发生发展都起重要的作用。
BSP法原理:用亚硫酸氢钠修饰处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶(C)被转化为尿嘧啶(U)而甲基化的胞嘧啶则不变。基因组DNA经亚硫酸盐处理后,设计BSP引物扩增目的片段,此时尿嘧啶(U)全部转化为胸腺嘧啶(T),最后对PCR产物进行测序就可以判断CpG位点是否发生甲基化。
BSP法原理:用亚硫酸氢钠修饰处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶(C)被转化为尿嘧啶(U)而甲基化的胞嘧啶则不变。基因组DNA经亚硫酸盐处理后,设计BSP引物扩增目的片段,此时尿嘧啶(U)全部转化为胸腺嘧啶(T),最后对PCR产物进行测序就可以判断CpG位点是否发生甲基化。
服务内容
1. 基因组DNA的Bisulfite转化。
2. BSP(Bisulfite Sequencing PCR)法,PCR产物直接测序,包括引物设计,不包括合成。
样品要求
·若提供基因组DNA,需≥2ug。
·若提供的材料为新鲜组织、血液、细胞等生物材料,请提供足够提取2ug以上基因DNA的材料量。
·基于所选择的DNA甲基化检测方法,请提供相应的引物或引物序列。
终产品
·Bisulfite处理的基因组DNA;
·实验报告(包括BSP产物的直接测序报告)。
服务说明
·在基于Bisulfite 转化的DNA甲基化检测的方法中,引物是决定实验成败的关键因素,且视期望检测的目的基因片段的不同,适宜引物的存在与否有较大的不确定性,请尽量采用其可行性经过验证的引物,如因引物等非本公司原因导致某实验步骤失败,使服务提前终止,已启动的实验项目正常收费。若需DNA甲基化检测用引物设计服务,价格另议。
·视BSP产物序列的不同,采用直接检测有可能导致实验结果的可靠性降低;视BSP引物特异性的不同,BSP产物的克隆测序存在插入片段与目的片段不符合的可能性,建议选择同时对多个克隆(>15个)进行测序,以获得足够的数据用于后期分析,最后提供客户5个有效克隆测序结果。