甲基化检测分析服务
产品名称: 甲基化检测分析服务
英文名称: DNA甲基化BSP
产品编号: SHDMT002
产品价格: 询价
产品产地: null
品牌商标: null
更新时间: 2024-04-21T11:36:05
使用范围: null
上海赛恒生物科技有限公司
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主要技术原理
用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,则未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而发生甲基化的胞嘧啶不变。根据某一待测位点或者调查的某一区域序列设计引物进行PCR扩增,通过PCR电泳、测序、荧光定量及质谱等方法对扩增产物进行检测,根据检测结果分析基因组甲基化的情况。
服务特点
精确度高,能明确目的片段中每一个CpG位点的甲基化状态
主要服务方案
1. 亚硫酸氢盐测序法(Bisulfite Sequencing PCR,BSP)
实验原理:
用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变。针对要调查的区域设计BSP引物进行PCR扩增,对扩增产物进行测序就可以判断哪些CpG位点发生了甲基化。根据测序方式不同,又分为以下几种:
a. BSP直接测序法:对于BSP引物扩增产物直接进行测序;
b. BSP克隆测序法:将PCR产物克隆,之后提取质粒进行测序,此方法成功率高、检测方便,适合常规数量样本的特定靶标区域甲基化分析,是国际通用的甲基化分析金标准;
c. BSP高通量测序法:可以进行目标片段甲基化水平分析,也可进行全基因组甲基化水平分析。
技术特点:准确度高、能给甲基化位点精确定位、可重复性高
实验流程:
(1)BSP引物设计:针对感兴趣的基因区域进行BSP引物的设计(一般扩增产物不超过300bp)
(2)亚硫酸氢盐处理基因组DNA:提取基因组DNA并进行亚硫酸氢盐的转化
(3)PCR扩增目的片段:BSP引物扩增感兴趣的区域
(4)克隆到载体:将PCR产物纯化后连接到T载体上
(5)克隆测序:挑取阳性*斑,提取质粒并测序
(6)序列分析:对测序的结果进行比对和甲基化分析(一般10个克隆子)
2. 荧光定量法(Methylight)
此方法利用TaqMan 探针和PCR引物来区分甲基化和未甲基化的DNA。首先用亚硫酸氢盐处理DNA片段,针对甲基化和未甲基化序列各设计一个探针,用不同的荧光标记,随后开展实时定量PCR。如果探针与DNA杂交则释放出荧光信号,根据荧光信号的强度比值计算甲基化水平。
技术特点
检测通量高。早期由于没有其它高通量的检测方式,用荧光定量法针对较多的样品进行检测时,是一个比较好的检测方案。但是该方法问题比较多,待检测的区域只有一个甲基化位点时,探针的区分度不高。同时,为了达到比较好的区分效果,一般采用MGB探针,探针成本较高。如果只是检测少量样品,探针分摊成本很高。现在针对较多的样品待检测时,通常都会采用高通量测序法,快速、准确,成本可控。
客户提供
1 要调查的基因名称、种属
2 要调查的甲基化区域或位点
3 足量的科研样本,保证样本质量,提供清晰样品编号
送样要求
1 样品要求:细胞≥105个;基因组DNA ≥5ug
2 所有样品建议干冰或冰袋运输,保证样品质量
检测周期
常规检测任务2-4周内完成,具体时间根据样本量和检测的基因数而定。
下单流程
直接订购:将需求内容给直接发送到gene@saihengbio.com,或致电:400-800-5152
报告内容
提供完整实验报告、电泳图、测序结果、序列比对结果、甲基化点状图、柱状图以及初步分析数据等。