miRNA芯片服务
产品名称: miRNA芯片服务
英文名称: miRNA Array service
产品编号: IBSBIO-A002g
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miRNA(microRNA)是一类长度约为17-25nt的内源性非编码RNA,广泛参与基因转录后调控活动,其中多数miRNA具有高度序列保守性、表达时序性和组织特异性。最近的研究表明,miRNA参与了各种各样的调节途径,包括细胞增殖与凋亡、生长发育、器官形成、造血过程、脂肪代谢、病毒防御等各种功能,具有重要的基因表达调控作用。
一、Agilent miRNA芯片及技术服务
作为miRNA芯片的后起之秀,Agilent miRNA芯片自上市之初就受到业界广泛关注,上市来,其优异的性能指标更是获得科研工作者的广泛认可。
Agilent miRNA 芯片技术可以从容应对以上挑战
1、特殊的探针设计,保证只识别成熟miRNA,
专利独享;
2、高度灵敏,可识别一个碱基差异,检测下限
<0.1 amol
3、样品需求量低,只需要100ng 总RNA
4、不需要分离miRNA,避免丢失及引起误差
5、宽的动态检测范围,检测丰度跨5个log,有
利于检测到更宽丰度范围的miRNA
6、高重复探针,每个miRNA至少重复20次
7、良好的实验表现,平均CV<10%,R2﹥0.99
二、Affymetrix miRNA芯片检测
简介
Affymetrix公司于2011年2月底推出了miRNA芯片的升级版本GeneChip miRNA 2.0,这款芯片不仅完全覆盖Sanger miRBase 15.0版本131个物种的所有miRNA成熟体,还包括人的2,334个snoRNA和scaRNA,并针对人、大鼠、小鼠的miRNA前体设计了2,202个探针组。前代miRNA芯片产品将于2011年9月30日停止供应。该芯片仅需约3-5 μg的total RNA就可以出色的完成实验,同时保证了卓越的特异性,是研究miRNA全面而准确的芯片工具。
检测原理
Affymetrix miRNA芯片检测,采用FlashTag Biotin RNA Labeling Kit进行样品标记过程,具有快速,精确,灵敏度高,重复性好的特点。RNA样品采用Poly(A) RNA聚合酶加尾,利用RNA连接酶将带有生物素标记的信号分子与之连接,连接产物和芯片进行杂交反应。可标记多种RNA样品:如total RNA;降解的RNA;低分子量RNA (LMW RNA)。整个标记过程可以在一个小时内完成。标记过程如下所示:
该方法高灵敏度主要归因于Genisphere的3DNA多聚体信号放大技术,该多聚体是由多条DNA交联并结合有生物素的带有许多分枝的生物大分子,每个3DNA分子结合有大约15个生物素,而普通标记物通常只结合一个生物素分子。
技术优势
全面:Affymetrix GeneChip miRNA 2.0一张芯片上覆盖131个物种的miRNA,还包括人的2,334个snoRNA和scaRNA,并针对人、大鼠、小鼠的miRNA前体设计了2,202个探针组进行全面检测;
灵敏:采用专利FlashTag Biotin RNA Labeling Kits,Total RNA最低起始量最低可至100ng(要求纯化后的total RNA达到1μg);检测线性范围大于1000;对85%的miRNA检测可检测到的1 attomoles;
准确:芯片重复性好,片间和片内相关系数大于0.95;无需进行miRNA扩增,克服了研究miRNA的困难;
质控完善:Affymetrix专业的探针设计和质控,保证杂交特异性。