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真菌18S rDNA/ITS菌种鉴定

真菌18S rDNA/ITS菌种鉴定

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产品名称: 真菌18S rDNA/ITS菌种鉴定

英文名称: 真菌18S rDNA/ITS菌种鉴定

产品编号: 006

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 真菌18S rDNA/ITS菌种鉴定

     传统的真菌分类鉴定主要依据是形态、生长及生理生化变化特征等特征。然而由于真菌种类繁,其生长形态、生理生化变化等随环境的变化也不稳定。因此,采用传统方法鉴定有其局限性。随分子生物技术发展,DNA序列已经广泛测序。通过对真菌保守变异序列测序,可进行菌种鉴定。目前常用的有18S rDNA和ITS。通过PCR扩增,测序,与GenBank中的已知序列进行比对后,判定真菌种类,将真菌划分到属或种。  
     北京美亿美生物提供扩增真菌18S rRNA序列,约1,700 bp,或ITS,大概在300-700bp,进行扩增,测序,BLAST,对样品进行鉴定。真菌的ITS (Internal Transcribed Space) 基因,包括ITS1及ITS2两部分,进化速度快,具有多态性,适于对亲缘关系较近的菌株进行区分鉴定。

     

服务要求
    1. 请提供基因组DNA、经菌种分离后带有单菌落的新鲜平板或斜面。
    2. 基因组DNA的浓度≥100 ng/μl,总体积≥20 μl,且无明显降解;平板或斜面应长有分离的单菌落。
    3. 如果测序结果出现如下套峰,视为样品不纯,本公司将收取全额实验费用。并建议克隆多个测序鉴定。
服务基本流程
    1. 进行引物设计合成;
    2. PCR扩增18S rDNA/ITS;
    3. PCR产物纯化;
    4. 测序,序列比对分析。
服务报告内容
    实验报告包括PCR产物照片、NCBI序列比对鉴定结果、测序报告、序列碱基图、以及剩余模板(可保存1个月)