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武汉言行生物科技有限公司
外显子组捕获测序服务

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产品名称: 外显子组捕获测序服务

英文名称: exon

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外显子组捕获测序服务

概 述 

    外显子组是指全部外显子区域的集合,该区域包含合成蛋白质所需要的重要信息,涵盖了与个体表型相关的大部分功能性变异。外显子组序列捕获及第二代测序是一种新型的基因组分析技术:外显子序列捕获芯片可在同一张芯片上以高特异性和高覆盖率捕获研究者感兴趣的目标外显子区域,后续利用Hiseq 2500测序直接解析数据。 

    与全基因组重测序相比,外显子组测序只需针对外显子区域的DNA即可,覆盖度更深、数据准确性更高,更加简便、经济、高效。可用于寻找复杂疾病如癌症、糖尿病、肥胖症的致病基因和易感基因等的研究。同时,基于大量的公共数据库提供的外显子数据,我们能够结合现有资源更好地解释我们的研究结果。
 
    目前,外显子组序列捕获芯片是:

1. NimbleGen Sequence Capture 2.1M Human Exome Array
2. Agilent SureSelect Target Enrichment System
Human Exome

    目前一张NimbleGen 2.1M芯片能同时捕获约18万个外显子和约550个miRNA,几乎覆盖了所有人类外显子区域,相对于传统的PCR方法该方法极大的提高了对于人类基因组中外显子区域的研究效率,并显著降低了研究成本。 

技术路线 

基因组DNA的随机打断

DNA片段的末端修复和接头的连接

芯片杂交捕获目的片段

PCR扩增捕获的DNA片段

捕获效率的检测

PCR产物连接后随机打断

DNA片段末端补平及加“A”碱基

DNA片段两端加测序接头

PCR扩增含测序接头的DNA片段

测序文库的检测

Solexa Hiseq 2000 测序

生物信息学分析

 

结果数据

1、基本数据分析
数据产出统计:对测序结果进行图像识别(Base calling),去除污染及接头序列;统计结果包括:测定的序列(Reads)长度、Reads数量、数据产量。 
2、高级数据分析
a. Clean reads序列与参考基因组序列比对;
b. 目标外显子区域测序深度分析;
c. 目标外显子区域一致序列组装;
d. 目标外显子区域SNP检测及在CCDS数据库中的注释;
e. 可变剪切、基因融合、外显子融合分析。

 

公司介绍


武汉言行生物科技有限公司提供各种蛋白质组学服务、代谢组学服务、高通量测序服务、生物芯片服务、荧光定量PCR服务、基因组编辑和整体课题外包等技术服务,成立于2008年。言行生物客户已发表《The Plant Journal》、《Proteomics》、《ES&T》、《PLoS ONE》、《BMC Genomics》等杂志。


公司以“言必信 行必果”为理念,竭力把更优的生物技术服务奉献给您!

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