转录组即某个物种或特定细胞在某一功能状态下产生的所有RNA的总和，是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是，转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下，其基因表达情况是不完全相同的。转录组测序（RNA-Seq）是指利用第二代高通量测序技术进行cDNA测序，全面快速地获取某一物种特定器官或组织在某一状态下的几乎所有转录本。相对于传统芯片而言，RNA-Seq无需预先设计探针，即可对任意物种的任意细胞类型的转录组进行检测，能够提供更精确的数字化信号，更高的检测通量以及更广泛的检测范围，是目前深入研究转录组复杂性的强大工具。
 
美吉优势
1. 拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台，可以根据合作伙伴要求灵活安排实验，实验周期短，质量可靠。
2. 拥有Roche 454和Illumina Solexa两种高通量测序平台，合作伙伴可根据具体需求进行选择，以获取最佳的实验结果。
3. 技术人员经验丰富，可以根据合作伙伴要求在第一时间提供实验方案、解决实验问题、分析实验结果。
4. 拥有专业的生物信息团队和大型计算机，可以为合作伙伴提供个性化的生物信息分析服务。

生物信息分析
1. 有参考基因组的转录组分析（Transcriptome analysis with reference genome）
A. 测序原始数据处理（质量剪切、污染序列去除等）
B. Contig和Unigene统计分析
C. Unigene功能注释（NR、GO 和KEGG等）
D. SNPs及SSR分析等
E. 基因表达差异分析（不少于两个样品）

 
2. 无参考基因组转录组分析（De novoTranscriptome Analysis）
A. 测序原始数据处理（质量剪切、污染序列去除等）
B. 短序列mapping至参考基因组序列
C. 基因功能注释
D. 基因结构分析
E. 可变剪切分析
F. 基因表达差异分析（不少于两个样品）
G. 预测新的基因
 
成功案例
美吉生物已成功完成包括线虫、牡蛎、对虾、蜜蜂、鲫鱼、鲤鱼、鸡、猪、油菜花、菊花、桃树等多个物种的转录组测序及分析。

最新发表文章
Nie QH, Fang MX, Jia XZ, et al.Analysis of muscle and ovary transcriptome of Sus scrofa: assembly, annotation and marker discovery. DNA Res, 2011, published on line.