产品简介

转录组广义上指某个物种或特定细胞在某一生理条件下产生的所有的RNA，包括mRNA、tRNA，rRNA、及Non-condingRNA，狭义上指所有mRNA的集合。转录组研究以基因功能及结构研究为基础和出发点，通过新一代高通量测序，能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息。

应用领域

1. 获得物种或者组织的转录本信息；
2. 得到转录本上基因的相关信息，如：基因结构，功能等；
3. 发现新的基因；
4. 基因结构优化；
5. 发现可变剪切；
6. 发现基因融合；
7. 基因表达差异分析；
8. 开发SNP和SSR等。

技术流程

提取总RNA--分离mRNA、去rRNA--合成cDNA--文库构建--桥式PCR--Illumina测序--数据分析

生物信息学分析内容

备注：可进行定制化分析

案例分享

案例一

通过转录组测序分析亨廷顿氏舞蹈症疾病的生物标志物[1]

提取91个亨廷顿氏舞蹈症突变携带者（27症状前和64有症状）和33个健康人的外周血总RNA，利用转录组测序分析，确定了167个疾病显著相关基因，其中处于免疫系统通路的基因在病人中的表达量低，最终确定了五个基因（PROK2，ZNF238，AQP9，CYSTM1和ANXA3）候选生物标志物。

案例二

RNA-seq分析家蚕转录组[2]

利用RNA测序技术探究不同发育阶段家蚕的基因表达模式，获得23461个转录本，其中5428个为新的转录本。家蚕基因组数据库中14623个预测的蛋白编码基因，在该家蚕转录组中鉴定到了11884个，覆盖率约81.3%，3,247个基因发生选择性剪接。

参考文献

[1] Anastasios Mastrokolias,et al. Huntington’s disease biomarker progression profile identified by transcriptome sequencing in peripheral blood. European Journal of Human Genetics,2015,23, 1349–1356.
[2]Yinü Li,et al.Transcriptome Analysis of the Silkworm (Bombyx mori) by High-Throughput RNA Sequencing.PLOS ONE,2012, e43713.

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