ATAC-seq+RNA-seq
产品名称： ATAC-seq+RNA-seq
英文名称： ATAC-seq+RNA-seq
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奥明（杭州）基因科技有限公司
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ATAC-seq和RNA-seq整合基因组学研究新策略
染色质的三维结构是经过一系列复杂而精密的表观遗传修饰而组装起来的结构信息，并且这种修饰是动态变化的，通过改变基因调控序列的开/关来控制基因的表达调控，使基因表达调控处于一个动态平衡的过程。染色质的可接近性是特异性反式作用因子和顺式调控元件相互作用的前提，它在多个水平上是动态变化的。
奥明基因走在科学最前沿，为广大客户提供ATAC-seq和RNA-seq整合基因组学研究新策略！通过ATAC-seq技术可以获得细胞在某特定时空下所有染色质展开区域的信息，可用于检测所有在该条件下发生转录的基因及其顺式调控元件；通过RNA-seq技术则可获得细胞在该特定时空下所有的转录本信息；将两者数据相整合则可推断相关基因上游的顺式调控序列，宏观分析细胞在该特定时空下整个基因组的调控网络。同时ATAC-seq测得的数据能更好的支撑和解释RNA-seq测得的数据，更为精确地探索基因高表达和低表达的转录调控机制。这一策略可以广泛应用于不同类型的细胞分化，肿瘤发生发展，以及胚胎发育等生物学过程的研究。
技术路线
ATAC-seq+RNA-seq技术服务步骤
ATAC-seq+RNA-seq数据分析步骤
| 产品 | 策略 | 推荐数据量 | |
| ATAC-seq | Hiseq PE150 | 30M reads (total reads) | 50个工作日 |
| 转录组测序 | 6G (clean data) |
样本要求
1. ATAC-seq：由客户制备细胞数目≥ 1 × 105个（推荐2 × 106个细胞）的细胞沉淀，用磷酸缓冲液洗涤且加入OmiFrost ATAC-seq专用冻存液冻存的细胞样品，样品保存期间切忌反复冻融；请用干冰运输样品到本平台，不超过48 h。
2. RNA-seq：完整且无污染的RNA样品，总RNA ≥ 1
μg (单次200 ng)，浓度≥ 50 ng/μl。