Small RNA 主要包括microRNA、siRNA（small interfering RNA）、piRNA（piwi-interacting RNA）三类。小RNA参与基因表达与调控、RNA的加工与剪切、蛋白质翻译、遗传“入侵”抑制、配子发生等重要生物学过程，是生命活动中必不可少的调控因子。小RNA中最主要组成的是微小RNA(microRNA, 简称miRNA),可通过识别靶mRNA 实现转录后的基因调控。研究表明, 包括癌症、心血管疾病、免疫系统疾病在内的多种疾病与miRNA 的调控作用密切相关。近年来, 由于小RNA测序技术的应用，越来越多的miRNA被发现和功能鉴定,并将广泛应用于疾病诊断、个性化治疗和预后等领域。

技术优势

1. 采用隶科基因独有的BioinfoSct^TM生物信息技术分析数据
2. 拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台，实验周期短，质量可靠
3. 拥有专业的生物信息团队和大型计算机，可以为客户提供个性化的生物信息分析服务
4. 技术专家经验丰富，可以根据客户要求提供实验方案、解决实验问题、分析实验结果

技术应用

通过小RNA基因组分析研究肝癌细胞miRNA-199功能

研究者通过小RNA测序技术首次获得了人正常肝脏、病毒性肝炎肝脏、肝硬化肝脏和人肝癌组织的miRNA组数据，了解到肝癌与正常肝脏miRNA的差别，通过4个独立的肝癌患者临床队列分析，发现人正常肝脏高丰度表达的miRNA-199在人肝癌中普遍性显著降低，并且miRNA-199的低表达与肝癌患者的生存期降低显著相关。进一步发现肝癌组织中组蛋白甲基化改变导致了miRNA-199表达降低，miRNA-199能够靶向抑制PAK4进而抑制下游的ERK信号通路，从而抑制了肝癌细胞的生长。

Hou J, et al. Identification of miRNomes in Human Liver and Hepatocellular Carcinoma Reveals miR-199a/b-3p as Therapeutic Target for Hepatocellular Carcinoma. Cancer Cell, 2011.

心脏结构特异转录组数据表明miRNA-mRNA之间存在保守的相互作用

研究者对鼠、比格猎犬和食蟹猴三个物种心脏的8个不同组织分别进行小分子RNA测序，通过表达水平上的负相关性和靶基因预测找出与心脏功能相关的 miRNA-mRNA之间的互作关系。在三个物种的心脏瓣膜和心肌中各鉴定出了9个和7个保守miRNA。同时，用原位杂交的方法也验证了心肌组织特异性 富集的miR-1和心脏瓣膜织特异性富集的miR-125b-5p和miR-204。

Vacchi-Suzzi C, Hahne F, Scheubel P, et al. Heart structure-specific transcriptomic atlas reveals conserved microRNA-mRNA interactions[J]. PloS one, 2013, 8(1): e52442.