系统特点

极大降低成本：不足传统测序成本的 1％；
超高通量：一次实验中产生大于50GB碱基的数据，预期在2010年底提升至93GB；
高精确性：数据精确度高,可以正确读取重复序列；
自动化：实验操作简单，无须微珠处理，无须乳化，无人工干预自动进行测序；
应用灵活性：从DNA测序到数字化基因表达到小RNA研究，可以进行全方位的基因组研究。

Solexa高速测序－基因分析技术

自从诺贝尔奖得主Sanger1977年发明双脱氧DNA测序方法后，该测序法已独占商业性的DNA测序技术20年，虽然其不断改善的自动化操作已经大大加速了测序的速度，使科学家们能提前几年完成人类基因组草图测序，并测出了另外几百种生物的基因组，但当前普遍使用的测序仪，一次只能读取1,000个左右的碱基，且DNA样品需要长时间的制备和分析，因而科学家们一直在寻求革命性的技术革新：高速测序技术。

这个突破性平台可以平行程序化地检测成千上万片段，采用专利的“DNA簇”技术和可逆性终止化学反应，可以一次反应读取500亿碱基。

其基本原理如下：
将随机分割的DNA片断连接到特殊的芯片表面，通过固相表面扩展可以生成上亿个“DNA簇”，每个DNA片断可被扩展约1000次。这些“DNA簇”被用做测序模板，在高速测序仪上进行测序。测序过程中用4种末端被封闭的不同荧光标记的碱基进行合成反应，每次反应只能加一个碱基，通过激光检测每次加入的碱基后，保护基团被脱去进入下一轮合成反应，再测定该次反应加入的碱基，如此反复。

该测序方法除用做基因组高速测序外，亦可用于很多于基因组相关的研究如大规模筛查基因突变,基因表达研究,小RNA研究,发现新SNP,核酸和蛋白相互作用及定位研,各种作用的基因靶点研究,甲基化研究等等。