LncRNA芯片全面解决方案
产品名称: LncRNA芯片全面解决方案
英文名称: LncRNA Chip
产品编号: BT10003
产品价格: 5500-6500
产品产地: null
品牌商标: null
更新时间: null
使用范围: null
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在人的基因组中,只有2%碱基用于编码蛋白,而有72%的碱基是可以转录的,因此ncRNA的存在有很大的空间。然而这些不编码蛋白的RNA(ncRNA)有什么作用呢?近些年,研究者们主要将目光聚集在短的ncRNA(miRNA)上,已经发现了数千个miRNA,其主要功能是调节基因的表达。但是我们不能忽视更长一些的也具有重要功能的long ncRNA。Long ncRNA (lncRNA) 是一类转录本长度超过200nt的RNA,它们本身并不编码蛋白,而是以RNA的形式在多种层面上调控基因的表达水平,已知作用则包括基因沉默、基因印记和反义抑制。随着近年来lncRNA不断被发现,人们开始关注LncRNA在各种生物学过程以及疾病中所起到的作用。通过lncRNA芯片,研究人员能够快速高通量的获得与特定生物学过程或者疾病相关的LncRNA的表达变化。
一、技术路线和方法:
二、生物信息学分析
2.1 基本数据分析
Part01:原始数据预处理与均一化
Part02:差异lncRNA筛选
Part03:聚类分析(层次聚类)
Part04:差异lncRNA靶基因预测
Part05:靶基因GO分类
Part06:靶基因Pathway分析
2.2 高级数据分析
Part08:差异lncRNA转录因子结合位点分析
Part09:差异lncRNA与靶基因调控网络
Part10:转录因子、lncRNA、靶基因互作网络
Part11:目标基因反向预测lncRNA
Part12:lncRNA引物设计
三、芯片平台
芯片平台 (Human) |
型号 | lncRNA\lincRNA数量 | 规格 | 货号 |
Agilent | SurePrint G3 Human Gene Expression 8x60K | 7419条lincRNA | 8×60K | BT1000311 |
27958条mRNA |
芯片平台 (Mouse) |
型号 | lncRNA\lincRNA 数量 |
规格 | 货号 |
Agilent | SurePrint G3 Mouse Gene Expression 8x60K | 16251条lincRNA | 8×60K | BT1000321 |
39430条mRNA |
五、完成时间
2个月,(其中生物信息分析1个月)
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