LC-MS mRNA碱基修饰检测-分子生物学服务 -技术服务-生物在线
上海康成生物工程有限公司
LC-MS mRNA碱基修饰检测

LC-MS mRNA碱基修饰检测

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产品名称: LC-MS mRNA碱基修饰检测

英文名称: LC-MS mRNA modification analysis service

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mRNA化学修饰的定量检测是表观转录组学研究所必不可少的环节。检测不同处理条件下的表观转录修饰变化将为下一步的研究提供重要线索。Aksomics(原康成生物)的质谱检测平台能够为客户提供全面而准确的mRNA修饰谱。利用Agilent质谱仪,检测36种修饰碱基在各个样品中的修饰丰度。

服务特色:

● 优化的前期处理与Agilent优质设备 

● 全面而准确的碱基修饰分析

分析流程:

图释:LC-MS mRNA修饰检测服务流程图。

分析种类:

NumberNucleosideSymbolNumberNucleosideSymbol
013′-O-methyladenosine3′-OMeA191-methylguanosinem1G
022′-O-methylcytidineCm207-methylguanosinem7G
035-methylcytidinem5C21N2-methylguanosinem2G
04N6-isopentenyladenosinei6A223′-O-methylinosine3′-OMeI
055,2′-O-dimethylcytidinem5Cm232-thiouridines2U
061-methyladenosinem1A244-thiouridines4U
072-thiocytidines2C255-methyluridinem5U
08N2,N2,7-trimethylguanosinem2,2,7G26N4-acetylcytidineac4C
09N4-acetyl-2′-O-methylcytidineac4Cm273′-O-methyluridine3′-OMeU
10N6-methyladenosinem6A285-methyl-2-thiouridinem5s2U
113-methylcytidinem3C295-methoxyuridinemo5U
123′-O-methylcytidine3′-OMeC30pseudouridineΨ
132′-O-methyladenosineAm312′-O-methylinosineIm
14N2,N2-dimethylguanosinem22G323-methyluridinem3U
155′-O-methylthymidine5′-OMeT333′-O-methylguanosine3′-OMeG
162′-O-methyluridineUm341-methylpseudouridinem1Ψ
17inosineI355-hydroxymethylcytidinehm5C
182′-O-methylguanosineGm365,2′-O-dimethyluridinem5Um

 

结果展示

1. 修饰定量分析

图释:mRNA修饰数量分析图。

2. 总离子流程图

图释:总离子流程图

3. 不同离子对合并Peak图

 优化的前期处理与Agilent优质设备,确保了各修饰碱基之间具有很好的区分度。

图释:不同离子对合并Peak图。