转座又称移位,是由可移位因子介导的遗传物质重排现象。
转座子(transposon,Tn)是存在于染色体DNA上可自主复制和位移的基本单位,研究表明转座子存在于所有的生物体内,人类基因组中有35%以上的序列为转座子序列,其中大部分与疾病相关。
转座子分为两大类∶插入序列(insertional sequence,IS)和复合型转座子。
插入序列
插入序列是最简单的转座子,它不含有任何宿主基因。它们是细菌染色体或质粒DNA的正常组成部分。IS是可以独立存在的单元,带有介导自身移动的蛋白,也可作为其他转座子的组成部分。
常见的IS序列较短(约1000bp),末端具有反向重复序列,转座时往往复制宿主靶位点一小段(4~15bp)DNA,形成位于IS两端的正向重复序列(图1)。
图1.插入序列
复合型转座子
复合型转座子是一类带有某些抗药性基因(或其他宿主基因)的转座子,其两侧通常是两个相同或高度同源的IS(图2),这说明IS插入到某个功能基因两端时就可能产生复合型转座子。一旦形成复合型转座子,IS的功能即被修饰无法再单独移动,只能作为复合体移动。大部分情况下,这些转座子的转座能力由 IS决定和调节。
图2.复合型转座子
根据转座机制的不同,可将转座子分为逆转录转座子和DNA转座子。逆转录转座子以RNA为媒介进行转座,采用“复制-粘贴”机制,即先将自身DNA转录形成RNA中间产物, 再逆转录产生新的DNA拷贝, 最后插入基因组的其他位置实现转座, 而原位点的转座子保持不变。DNA转座子则以DNA为媒介进行转座,采用“剪切-粘贴”转座机制,在转座酶的作用下, 转座子从原位置切除下来并整合到新的位点。DNA转座子相对逆转录转座子而言,转座效率高,易被人为改造,因而应用较为广泛,其具体转座机制如图3。
图3.DNA转座子转座机制
野生型的DNA转座子中通常含有转座酶编码序列 , 转座酶通过识别转座子两端的ITR(反向末端重复序列), 介导转座子发生转移。经人工改造后,中间的转座酶编码序列可被其它外源DNA序列所替换, 在细胞中转座酶存在的情况下发生转座, 从而将外源DNA插入基因组中, 实现转基因操作(图4)。
图4. DNA转座子实现转基因操作的机制示意图A:野生型DNA转座子B:人工修饰的转座子载体C:转座酶表达载体
目前,已在真核生物中发现数十种DNA转座子,具体分类和特征如下:
转座子可以在基因组任意位置插入和切除,常用于哺乳动物细胞基因编辑研究中。目前发现的可用于哺乳动物基因转移的DNA转座子系统主要有以下3类:
1、类hAT转座子——Tol 2,未经改造在天然状态下即可作用于脊椎动物的转座子,从日本青鳉鱼的基因组中分离出来;
2、两个类Tc1转座子——Sleeping Beauty ( SB) 和 Frog Prince ( FP),分别从鲑鱼和青蛙基因组中分离重建;
3、Piggy Bac超家族成员——Piggy Bac(PB),从甘蓝蠖度尺蛾基因组中分离出来,目前研究者已将其应用领域拓展至鱼类、寄生虫和哺乳动物等转基因研究中。研究表明,PB转座系统在小鼠等胚系细胞具有较强的转座活性。
☞转座子的遗传学效应
① 引起插入突变 各种 IS、Tn 转座子都可以引起插人突变。
② 产生新基因 如果转座子上带有抗药性基因,它一方面造成靶DNA 序列上的插入突变,同时也使这个位点产生抗药性。
③ 产生染色体畸变 当复制型转座发生在宿主DNA原有位点附近时,往往导致转座子两个拷贝之间的同源重组,引起DNA缺失或倒位。
④ 引起生物进化 由于转座作用,使原来在染色体上相距甚远的基因组合到一起,构建成一个操纵子或表达单元,可能产生有新的生物学功能的基因和新的蛋白质分子。