1.需要用户自己准备的耗材和试剂a.PBS C0221A,或PBS (pH7.2-7.6)。
b.固定液(免疫染色固定液P0098,或4%的多聚甲醛P0099)。
c.洗涤液(免疫染色封闭液P0102,QuickBlock™免疫染色封闭液P0260,或含3% BSA的PBS)。
d.通透液(免疫染色强力通透液P0097,免疫染色洗涤液P0106,或含0.3% Triton X-100的PBS)。
e.去离子水或超纯水。
f.根据实验要求:18×18mm盖玻片,6孔板或其它多孔板,或流式细胞分析仪用管子(如12×75mm)。
2.检测体系的准备
a.如下以6孔板或常规切片检测体系为例,如果使用12孔板、96孔板或384孔板等孔板,检测体系可以相应按比例缩小。
b.如果检测的是悬浮细胞,请按常规的悬浮细胞的操作方式进行。例如和贴壁细胞相比,相关步骤需要增加离心步骤等,如1000×g室温离心5min。
3.培养细胞的EdU标记及固定、洗涤和通透
a.在6孔板中(如有必要可以加入盖玻片)培养适当数量的细胞。细胞培养过夜并且恢复到正常状态后,进行所需的药物处理或者其它刺激处理等。
b.配制2X的EdU工作液:由于EdU工作液是与培养液等体积加入到孔板中,所以需要配制成2X的工作液。推荐的EdU终浓度为10μM (1X),用细胞培养液1:500稀释EdU (10mM)即可得到2X的EdU工作液(20μM)。
注意:对于A549、HeLa和NIH/3T3等贴壁细胞,推荐EdU的使用终浓度为10μM。但细胞类型、培养液种类、细胞密度、细胞增殖速度等多方面的因素会影响EdU掺入到细胞中的量,因此初次使用时建议对EdU的使用浓度进行一定的摸索。如果之前使用过BrdU进行实验,则可以参考BrdU的终浓度作为EdU的终浓度。
c.将37℃预热的2X的EdU工作液(20μM),等体积加入6孔板中,使6孔板中的EdU终浓度变为1X。例如设计终浓度为10μM,原先6孔板中的培养基为1ml,则将1ml 2X的EdU工作液(20μM)加入到孔板中。如果培养基体积过大,可以先吸除适量的培养液,再加入等体积的2X的EdU工作液;或者可以减少工作液的体积并增加EdU的浓度,使最终培养液中的EdU浓度为10μM,例如2ml培养液中加入220微升0.1mM EdU。更换所有的培养液可能会对细胞的增殖有影响,因此不建议替换所有的培养液。
d.继续孵育细胞2小时。该孵育时间的长短取决于细胞生长速率,通常宜继续孵育细胞周期10%左右的时间。对于常见的哺乳动物细胞如HeLa、3T3、HEK293等,细胞周期大约在18-25小时,孵育时间宜在2小时左右。人胚胎细胞的细胞周期约30分钟,推荐的孵育时间为5分钟;酵母细胞的细胞周期约3小时,推荐的孵育时间为20分钟,增殖的神经细胞其细胞周期约5天,推荐的孵育时间为1天。孵育时间小于45分钟时,建议提高EdU的浓度;孵育时间大于20小时时,建议适当降低EdU的浓度。
e.EdU标记细胞完成后,去除培养液,并加入1ml固定液(可以使用免疫染色固定液P0098,或4%的多聚甲醛P0099),室温固定15分钟。注:对于流式细胞仪检测,贴壁细胞胰酶消化后用培养液重悬后再固定。
f.去除固定液,每孔用1ml洗涤液洗涤细胞3次,每次3-5分钟。
g.去除洗涤液,每孔用1ml通透液(可以使用免疫染色强力通透液P0097,免疫染色洗涤液P0106,或含0.3% Triton X-100的PBS),室温孵育10-15分钟。
h.去除通透液,每孔用1ml洗涤液洗涤细胞1-2次,每次3-5分钟。
i.转步骤5。
4.动物体内EdU的标记及切片样品的处理
EdU可以通过注射或进食等适当方式进行动物的体内标记。如下以小鼠为例,其它动物体内EdU的标记请参考相关文献。
a.对于小鼠,可以按照10-200mg/kg的用量,把EdU用PBS配制成一定浓度,腹腔注射、特定组织或器官局部注射或者加入饮用水中。具体用量跟所用动物的种类、体重和使用方式有关,可以参考相关文献,因此初次使用时建议对EdU的使用浓度进行一定的摸索,或者直接使用50mg/kg的浓度进行测试。如果之前使用过BrdU进行实验,则可以参考BrdU的终浓度作为EdU的终浓度。EdU可以单独购买ST067。
b.4小时后或根据特定实验确定的适当时间后,快速处死小鼠,取出所需的组织,按照常规步骤制作冰冻切片或石蜡切片。EdU标记的时间也可以参考相关文献自行调整。
c.对于冰冻切片:
(a)加入适量固定液(可以使用免疫染色固定液P0098,或4%的多聚甲醛P0099),室温固定15分钟。
(b)去除固定液,用适量洗涤液洗涤3次,每次3-5分钟。
(c)去除洗涤液,用适量通透液(可以使用免疫染色强力通透液P0097,免疫染色洗涤液P0106,或含0.3% Triton X-100的PBS),室温孵育10-15分钟。
(d)去除通透液,用适量洗涤液洗涤1-2次,每次3-5分钟。
(e)抗原修复(选做):如果同时需要进行目的蛋白的免疫荧光染色,并有必要进行抗原修复,可以使用适当的抗原修复液,例如P0090冰冻切片快速抗原修复液(5X),或者自行配制的适当的抗原修复液进行抗原修复处理。
(f)转步骤5。
d.对于石蜡切片:
(a)脱蜡:二甲苯中脱蜡5-10分钟。换用新鲜的二甲苯,再脱蜡5-10分钟。无水乙醇5分钟,换新的无水乙醇3分钟。95%乙醇3分钟。85%乙醇3分钟。75%乙醇3分钟。50%乙醇3分钟。PBS 5分钟。
(b)抗原修复(选做):如果同时需要进行目的蛋白的免疫组化染色,可以使用适当的抗原修复液,例如P0081柠檬酸钠抗原修复液(50X)、P0083改进型柠檬酸钠抗原修复液(50X)、P0085 EDTA抗原修复液(50X)、P0086柠檬酸钠-EDTA抗原修复液(40X)、P0088通用型强力抗原修复液(10X)、P0092漂片抗原修复液(10X),或者自行配制适当的抗原修复液进行抗原修复处理。
特别注意:如果使用蛋白酶K或胰酶进行抗原修复,必须反复洗涤干净,否则残留的酶会严重干扰后续标记反应。
(c)转步骤5。
5.EdU检测
注意:本步骤六孔板中每孔的反应体系为500μl的反应混合物。对于12、24、48、96和384孔板,每孔的反应的体系分别为200μl、100μl、70μl、50μl和20μl的反应混合物。对于较小的孔,单位培养面积的液体用量已经适当增加,以有效避免液体蒸发可能带来的负面影响。对于切片,可以根据切片大小,每个切片使用100-200μl的反应混合物。如下以六孔板中的细胞样品为例说明具体的操作方法,对于其它孔板或切片,仅每步溶液的用量按比例调整即可,其余方法相同。
a.配制Click Additive Solution:对于C0071S,用1.3ml去离子水溶解一管Click Additive,混匀至全部溶解,即为Click Additive Solution;对于C0071L,加入10.4ml去离子水溶解试剂盒中提供的一瓶Click Additive,混匀至全部溶解,即为Click Additive Solution。配制后可以适当分装,并-20℃保存。
b.参考下表配制Click反应液。注意:请严格按照下表中组分顺序和体积配制Click反应液,否则点击反应可能无法有效进行;同时,Click反应液须在配制后15分钟内使用。
组分 | 6孔板样品数 | ||||||
1 | 2 | 4 | 5 | 10 | 25 | 50 | |
Click Reaction Buffer | 430μl | 860μl | 1.72ml | 2.15ml | 4.3ml | 10.75ml | 21.5ml |
CuSO4 | 20μl | 40μl | 80μl | 100μl | 200μl | 500μl | 1ml |
Azide 488 | 1μl | 2μl | 4μl | 5μl | 10μl | 25μl | 50μl |
Click Additive Solution | 50μl | 100μl | 200μl | 250μl | 500μl | 1.25ml | 2.5ml |
总体积 | 500μl | 1ml | 2ml | 2.5ml | 5ml | 12.5ml | 25ml |
c.去除上一步骤中的洗涤液。
d.每孔加入0.5ml Click反应液,轻轻摇晃培养板以确保反应混合物可以均匀覆盖样品。
e.室温避光孵育30分钟。
f.吸除Click反应液,用洗涤液洗涤3次,每次3-5分钟。
g.如果需要对细胞核进行染色,可以参照步骤6进行。如无其它的特殊需要,即可在荧光显微镜下观察,或者使用流式细胞仪、多功能酶标仪进行荧光检测,或者用高内涵筛选仪器(一般高内涵筛选需要使用染料对细胞核进行染色)进行检测。Azide 488的最大激发波长是495nm,最大发射波长是519nm。
6.细胞核染色
为了检测细胞增殖的比例,可以考虑使用Hoechst 33342进行细胞核染色。一般高内涵筛选仪器也需要对细胞核进行染色。
a.1X Hoechst 33342溶液的配制:按1:1000比例用PBS稀释Hoechst 33342 (1000X)。
b.接上述步骤5g,吸除洗涤液后,每孔加1X Hoechst 33342溶液1ml,室温避光孵育10分钟。
c.吸除1X Hoechst 33342溶液。
d.用洗涤液洗涤3次,每次3-5分钟。
e.随后即可进行荧光检测。Hoechst 33342为蓝色荧光,最大激发波长为346nm,最大发射波长为460nm。
7.流式细胞仪检测
对于经步骤5或6获得的细胞悬液样品进行流式检测。如果使用传统的流体动力学聚焦的流式细胞仪来测量总DNA含量,请在检测过程中使用低流速,实验中的每个样品应使用相同的收集速率和细胞浓度。EdU标记产生的荧光信号一般使用对数刻度的横坐标(如图4中的横坐标)。Azide 488的最大激发波长是495nm,最大发射波长是519nm。
注1:建议使用未经EdU标记的细胞样品作为流式细胞仪检测的阴性对照,并选择合适的电压。
注2:由于流式细胞仪检测比较灵敏,可根据细胞类型和实际染**况对Azide 488的使用量进行适当调整。